b.limour.top/source/_posts/复旦高性能计算-六-jupyter启用r内核.md

---

title: 复旦高性能计算 (六) jupyter启用R内核 tags: [] id: '1098' categories:

• - 生物信息学
• - 超算基础 date: 2021-10-22 19:10:23 ---

第一步 启用镜像

install.packages("BiocManager", repos="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/" )
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")

第二步 安装依赖

install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools', 'uuid', 'digest', 'cairo', 'IRkernel'), repos="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/" )

第三步 启用R内核

IRkernel::installspec(user = FALSE)

第四步 解决图片输出问题

复旦高性能计算 (三) jupyter R内核 png设备问题的解决方法