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title: 通过conda安装纯净环境的Seurat tags: [] id: '1619' categories:

• • 超算基础 date: 2022-02-13 16:05:35 ---

• conda create -n seurat -c conda-forge r-base=4.1.2

• conda activate seurat

• conda install -c conda-forge r-seurat=4.1.0

• conda install -c conda-forge r-irkernel

• R

• IRkernel::installspec(name='seurat', displayname='r-seurat')

• q()

经过长期实践，用好conda真能省心高效方便！建议不要在base环境中安装除conda之外的任何包（有些包会和conda的依赖冲突，此时用conda创建的新环境就可以避免这个问题），然后每一个独立的功能都单独建一个新环境。

注：如果出现失败，一般是默认安装的版本太低，此时应使用r-base=4.1.2来指定最新版本。可以在此搜索最新的版本：https://anaconda.org/search?q=r-seurat

重要的事情说三遍：不要自行尝试编译安装，维护起来很难！不要自行尝试编译安装，维护起来很难！不要自行尝试编译安装，维护起来很难！