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title: Seurat (一) 安装 tags: [] id: '643' categories:

• - Seurat教程
• - 生物信息学
• • 超算基础 date: 2021-09-19 21:40:07 ---

• 安装BiocManager：install.packages("BiocManager", repos="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/" )

• 为BiocManager添加镜像：options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")

• 安装Seurat：BiocManager::install("Seurat")

• 安装devtools：BiocManager::install("devtools")

• 通过devtools在线安装：devtools::install_github("github_user_name/package_name")

• 通过devtools离线安装：devtools::install_local("path_to_package_file.zip")

• 查看或设置lib路径：.libPaths("<dirPath>")

• 离线安装包：install.packages("<filePath>", repos = NULL)

• 命令行安装离线包：R CMD INSTALL package.tar.gz