【迁移】STAR:一键脚本 2023-09-27更新:添加了转录本计数相关内容 一些依赖 安装 biobambam 项目地址:https://gitlab.com/german.tischler/biobambam2 1conda create -n biobambam -c bioconda biobambam -y 安装 star 1234conda create - 2022-07-02 #STAR
【迁移】CellTypist 注释免疫细胞亚群 安装CellTypist并配置环境,加载所需的包,加载数据,将Seurat对象转换为scanpy对象,对每个细胞进行观察,对基因矩阵进行注释,组装AnnData对象,进行预测,并将预测结果添加到Seurat对象中。 2022-02-22 #celltypist #生信 #分群 #注释
【迁移】二代测序数据处理之数据格式说明 FASTA(.fa) 储存参考数据集 从零开始完整学习全基因组测序(WGS)数据分析:第2节 FASTA和FASTQ 基本单元 序列所表示的基因名:>ENSMUSG00000020122ENSMUST00000138518,后可接空格表示注释前缀 具体序列信息:CCCTCCTATCATGC……GGGCCCACCTGTTCTCTGGT 基因名独占一行,序列信息为基因名后一行至下一个 > 2022-01-17 #NGS #fasta #fastq #gft #bam
【探索】利用后缀表达式解方程 这段Python代码实现了使用后缀表达式解方程的功能。它包括了一个栈类(Stack)和一个多项式类(Polynomial)。通过中缀表达式转后缀表达式的方式处理方程,最终实现了解一元一次方程的功能。代码包含了多个方法,如多项式的加法、减法、乘法、除法等操作。在解方程时,它先进行表达式的简化和转换,然后输出方程的解或者判断方程是否是一元一次方程。 2020-12-12 #探索
【迁移】树莓派开启蓝牙个人区域网 开启 SSH 连接 boot 目录下新建 ssh 的空文件 boot 目录下新建 wpa_supplicant.conf 1234567891011121314151617country=CNctrl_interface=DIR=/var/run/wpa_supplicant GROUP=netdevupdate_config=1 network={ssid="Limour 2020-03-31 #raspberrypi #ssh