通过vmware构建本博客使用的生信处理环境.md 3.2 KB
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- - 环境 comments: false date: 2022-08-01 01:30:20 ---
使用Windows系统，安装Docker需要开启WSL2，可能存在未知的BUG，操作和维护也不是那么轻松，因此本文将教大家如何使用VMware安装Ubuntu，再通过Ubuntu安装Docker，然后通过Docker安装Jupyter Docker Stacks
第一步 安装VMware
复旦大学是VMware学术计划成员，因此在校师生可以在遵循相关协议的前提下免费使用VMware学术计划内所包含产品。点此按信息办的步骤即可完成VMware的安装
第二步 安装Ubuntu
从Ubuntu官网下载ISO镜像，创建虚拟机
选择典型
选择ISO镜像路径
选择虚拟磁盘保存路径，建议新建空文件夹
磁盘大小设置大一点
一路默认，到这里选择开启SSH，安装完成后会提示reboot，之后会提示移除CD安装镜像
- 重启后输入账号密码登录
- sudo apt install net-tools
- sudo ifconfig 记录下服务器IP
- 使用FinalShell等SSH工具进行连接
第三步 Ubuntu换源
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ jammy main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ jammy main restricted universe multiverse
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ jammy-security main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ jammy-security main restricted universe multiverse
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ jammy-updates main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ jammy-updates main restricted universe multiverse
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ jammy-backports main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ jammy-backports main restricted universe multiverse
- sudo -i
- nano /etc/apt/sources.list
- apt update
第四步 安装docker
{
"registry-mirrors":[
"https://hub-mirror.c.163.com/",
"https://docker.mirrors.ustc.edu.cn/"
]
}
curl -sSL https://get.daocloud.io/docker shcurl -L https://get.daocloud.io/docker/compose/releases/download/v2.8.0/docker-compose-$(uname -s)-$(uname -m) > /usr/local/bin/docker-composechmod +x /usr/local/bin/docker-composedocker -vdocker-compose -v- nano /etc/docker/daemon.json
- systemctl daemon-reload
- systemctl restart docker
第五步 磁盘扩容
- vgdisplay
- lvresize -l +100%FREE /dev/mapper/ubuntu--vg-ubuntu--lv
- resize2fs /dev/mapper/ubuntu--vg-ubuntu--lv